Da die Klosterkapelle des St.-Barbara-Gymnasiums zu klein geworden war, wurde die St.-Barbara-Kirche als neue Gymnasium-Kirche gebaut. 1855 legte der italienische Kardinal Matteo Gonelle den von Papst Pius IX. geweihten Grundstein. Drei Jahre später wurde die Kirche erstmals für Gläubigen geöffnet.

Pater Jesuit Prosper Coppens, der Designer dieser Kirche, hatte ursprünglich sehr ehrgeizige Pläne. Der Architekt Frans Steyaert konnte diese Pläne aus Geldmangel nie vollständig erledigen.

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